不服一审判决，王新海提起上诉，他认为，采用签外协报劳务费是以变通方法解决报销在研究、实验中产生的相关费用，是为了科研顺利运行。一审判决事实不清，量刑过重。

报道还称，该案已经由台湾“中科院”进行研发，在5日上午举行的说明会上，台湾“中科院”说明了微型飞弹突击艇的计划，排水量满载约45吨、全长约21.4公尺、全宽约5.4公尺、满载时船速最高航速35节以上。不过，该项计划还在评估当中，举行说明会是先行听取岛内造船业的意见以及成本上的估算，是否进入下一阶段还要进一步考量。

《窝洛沽疑案：申冤3年终得无罪判决 真凶仍是谜》评论家黄秋耘写了很多当时看来完全够右派资格的文章，林绍纲至今记得他有一篇文章叫《刺在哪里》，文辞严厉。但邵荃麟是黄秋耘在香港做地下工作时期的老领导，对他知根知底，党组会上将他力保了下来，只做留党察看。